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    • 4-Mobilome Engineering for Large-Fragment Transfer and Genome Minimization
    2025-12-12
    我们长期致力于探究细菌间遗传相互作用的机制。在假交替单胞菌研究中，我们发现基因组岛GIprfC虽缺乏典型的转移基因，却可通过与整合接合元件（ICEs）的顺式串联整合实现转移。进一步研究发现，ICEs能激活并驱动定植于基因组内的可移动基因组岛（MGIs），实现跨物种的反式转移。这些发现为基于移动基因组的大片段DNA转移机制奠定了理论基础。为实现精准的基因组精简，我们开发了Cas9-NE策略。该策略能同步清除整合态与多拷贝环状形...
    5-Deciphering Molecular Recognition at Bio-Abiotic Interfaces
    2025-12-12
    我们专注于鉴定与改造介导微生物底盘与功能纳米材料相互作用的关键膜蛋白，旨在优化生物杂合系统在二氧化碳增值转化中的稳定性与效率。我们开发了原位垂钓技术以分析蛋白冠形成的动态过程，借此解析主导生物-非生物识别的特异性表面蛋白。通过这种方法，我们揭示了调控纳米粒子相容性与界面电子转移的分子机制。这些发现为设计新一代抗逆性微生物细胞工厂及自组装生物杂合平台提供了关键科学依据与创新策略。参考文献 https:/...
    3-Machine-learning-enabled ¹³C Fluxomics
    2025-12-12
    我们开发出了一种通用型超快速计算流程，该流程通过学习从模拟质谱同位素峰群分布向量（MDV）到局部通量比值的映射关系，进而结合实测交换通量解析细胞内全局通量分布。该工作流通过基于代谢物单元的网络分解与通量采样自动生成训练数据，程序化筛选通量比值的“可解性”，遴选信息丰富的MDV特征，并为每个通量比值训练专用估计器（深度神经网络与集成学习方法）——同时利用氨基酸及中间代谢物MDV数据可显著提升精度。经传统13C代谢...
    2-Efficient CO₂ Valorization via Delivery of Exogenous Electrons into Cyanobacterial Photosystem I
    2025-12-12
    我们正在开发一种混合型生物电化学系统，用于实现二氧化碳的高效增值转化。该系统将外源电流直接导入蓝藻光合系统I以驱动二氧化碳固定过程，从而达成极高的能量转化效率。这种电驱光合作用能够生产出比人工光合作用产物结构更为复杂的碳氢燃料，同时强化碳代谢关键基因产物的合成。通过将外部电子或还原态单碳代谢物与光能相结合，该设计突破了天然光合作用的能量转化局限，为将二氧化碳转化为高价值有机化合物提供了稳定高效的路...
    1-Research
    2025-11-12
    本科研团队致力于从分子层面构建生物系统，以推动可持续发展和生物制造进程。我们着力开发前沿人工智能合成生物学工具及生物杂合平台，以实现二氧化碳的高效增值利用，同时致力于揭示调控微生物细胞工厂的遗传机制与进化原理。[en]Our research group is dedicated to engineering biological systems at the molecular level to advance sustainability and biomanufacturing. We develop cutting-edge AI-driven synthetic biolo...