农工党华南理工大学总支前身是农工党华南工学院小组，成立于1953年上半年，共3位党员。1956年1月，农工党华南工学院支部成立。1988年改称为农工党华南理工大学支部。1992年11月，农工党华南理工大学总支委员会成立，至今共经历了七届支部。农工党总支曾有多位党员担任省委会领导职务，包括中央常委、省委会主委谭盈科，省委会副主委康辛元、华贲等。历任主委有龙惕吾、谭盈科、潘大任、苏国雄、华贲、邓先和、蔡国强、钟理、林章凛。现任主委王永华。截至目前，共有党员49人。