1952年，华南工学院成立伊始，设立化学工程系，在食品工学本科专业设立发酵工学专门化

1958年，以化工、造纸两系为基础，组建华南化工学院，在食品工学系设置微生物工学专业

1962年，华南化工学院并入华南工学院，设生化系，在生化系设置微生物工学专业。（12月调整设立化工二系，1963-1971年，该专业办与食品工学专业合并）

1970年，广东化工学院成立，设轻化工系，设置工业微生物专业

1972年，在轻化工系设置工业发酵专业

1978年，广东化工学院并入华南工学院。初设轻化工系，设置工业发酵专业

1979年，在轻化工系设置微生物工程专业

1981年，发酵工程二级学科硕士点获得授权

1982年，系、专业调整，设化学工程二系，设置微生物工程专业

1984年，设置生物化工专科专业

1985年，华南工学院化学工程二系改称为华南工学院轻化工程系

1985年，在食品工程系设置生物化工专业

1986年，学校成立生物工程研究所

1991年，设立轻工技术与工程博后流动站，其中包括发酵工程方向

1994年，成立华南理工大学轻工食品学院，设生物工程系并设置生物化工专业、设置生物制药专科专业

1995年，在生物化工系设置生物制药专业

1996年，生物化工二级学科硕士点获得授权

1997年，成立食品与生物工程学院，设置生物工程、生物制药本科专业

1998年，轻工技术与工程一级学科获博士学位授权点

1998年，生物化工二级学科博士点获得授权

2001年，轻工技术与工程领域工程硕士点获得授权

2003年，微生物学、生物化学与分子生物学二级学科硕士点获得授权；生物工程领域工程硕士获得授权

2004年，成立生物科学与工程学院，设置生物工程、生物技术、制药工程（生物制药）、生物医学工程本科专业（该专业2012年转入材料学院）

2005年，广东省发酵与酶工程重点实验室、工业生物技术广东省普通高校重点实验室批准建设

2006年，生物学一级学科硕士点获得授权

2008年，微生物学二级学科博士点获得授权

2009年，学院和深圳华大基因研究院合办的基因组科学创新班学生2006级生物技术本科生金鑫、2007级生物工程本科生罗锐邦，分别以署名作者和并列第一作者，在（Nature）的生物技术分刊《Nature Biotechnology》上发表了由深圳华大基因研究院领衔、华南理工大学主要参与的合作研究论文《构建人类泛基因组序列图谱》。基因组科学创新班的培养模式在国内外引起强烈反响，被誉为“国内本科人才培养的奇迹”，一场“静悄悄的教育革命”

2010年，“华南理工大学-深圳华大基因研究院”创新学院成立

2011年，生物学一级学科博士点获得授权

2012年，生物学一级学科获广东省重点学科

2013年，生物学与生物化学学科首次跻身ESI排名

2013年，自设医药生物学二级学科硕士点、博士点获得授权

2013年，本科专业设置为生物工程、生物技术、生物制药三个专业

2014年，学院校友会暨第一届校友理事会成立

2015年，广东省生物酶与工业绿色加工工程技术研究中心批准建设

2016年，药学领域专业学位获得授权

2017年，教育部“合成生物学与药物制备”国际合作联合实验室批准建设

2017年，广东省生物制药工程技术研究中心批准建设

2018年，自设细胞生物学二级学科

2019年，获批生物学博士后流动站

2020年，生物工程专业入选国家级一流本科专业建设点，生物技术入选省级一流本科专业建设点

2021年，生物技术、生物制药专业入选国家级一流本科专业建设点

2022年，生物工程专业顺利通过中国工程教育专业认证协会组织的工程教育认证

（数据更新截止于2024年3月6日）